Aqui está uma lista dos melhores softwares de fluxo gratuitos para Windows. Esses freewares são usados para analisar dados de citometria de fluxo armazenados no Padrão de Citometria de Fluxo (FCS). Alguns deles também suportam arquivos TXT para o mesmo. Eles fornecem diferentes tipos de gráficos para visualizar, interpretar e analisar dados de experimentos de citometria de fluxo. Esses tipos de gráficos incluem Gráfico de Pontos, Gráfico de Densidade, Gráfico de Intensidade, Histograma, Histograma de Sobreposição, Distribuição Cumulativa, etc. . gráficos. Você também pode visualizar estatísticas totais como eventos, média X/Y, geomean, mediana, etc. Uma delas fornece um grande número de ferramentas de análise estatística, incluindo Calculadora de estatísticas, Calcular proporção de dois parâmetros, Calculadora de célula avançada, etc.
Para analisar gráficos elaborados, esses softwares também fornecem ferramentas como criar região, marcador, quadrantes, zoom, pan, etc. Eles permitem que você salve dados estatísticos em um arquivo TXT. Você pode até exportar plotagem para uma imagem como PNG, BMP, etc.
Meu software de fluxo livre favorito para Windows:
Flowing Software é meu software de citometria de fluxo favorito para Windows. Ele fornece um bom número de ferramentas para analisar arquivos FCS. Além disso, sua interface de usuário é bastante simples e intuitiva.
Flowing Software
Flowing Software é um software de citometria de fluxo simples e fácil de usar para Windows. Ele vem com várias ferramentas para analisar dados de experimentos de citometria de fluxo. Ele permite realizar análises de citometria de fluxo em dados armazenados em arquivos FCS e TXT (delimitados por tabulações). Ele fornece um wi-fide gama de ferramentas em diferentes categorias que são as seguintes:
- Ferramentas de visualização: esta categoria contém as principais funções de análise gráfica, incluindo Dot Plot, Density Plot, Intensity Plot, Histogram, e Histograma de sobreposição.
- Ferramentas de metadados: Aqui você encontra Visualizador de metadados, Matriz de compensação, Visualizador de dados de parâmetros e Palavra-chave Visualizador.
- Ferramentas de cálculo: as ferramentas Calculadora de estatísticas, Calcular proporção de dois parâmetros, Calculadora avançada de células e Token podem ser acessadas aqui.
- Ferramentas de modificação de parâmetros: a partir daqui, você pode alterar nomes de parâmetros, alterar visualização de lin/log e criar eixo de tempo.
- Ferramentas de modificação de dados: você pode encontrar Ganho virtual e Compensar dados funções aqui.
- Ferramentas de coleta: esta categoria oferece ferramentas como Coletor de imagens, Lista de coletores, etc.
- Outras ferramentas: Algumas ferramentas adicionais, como Caixa de texto, Grupo de ferramentas, Ferramentas de controle de região, Ferramentas de automação (Executor de pastas, Contador de atualizações, etc.), etc. também disponível neste software fluido.
Como realizar análise de citometria de fluxo usando o Flowing Software
- Em primeiro lugar, no menu Arquivo, abra Nova análise. Agora, no menu Criar, selecione uma ferramenta para análise de citometria de fluxo. Agora você pode abrir um arquivo FCS ou TXT contendo experimentos de citometria de fluxo e analisar seus dados relacionados. Ele permite que você selecione várias ferramentas, uma por uma, e abra análises relacionadas na interface principal.
- Você pode criar estatísticas (eventos, média, geomean, mídia, etc.), criar regiões, copiar dados para a área de transferência, exportar dados para arquivo TXT, etc.
- Você pode salvar toda a análise em seu formato nativo para mais tardeusar.
Em suma, este é um ótimo software de fluxo para usar para realizar análises de citometria de fluxo. É bastante fácil de usar, mas caso encontre alguma dificuldade, consulte este tutorial em vídeo.
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FlowPy
FlowPy é o próximo fl gratuitosoftware para Windows nesta lista. Você pode abrir um arquivo FCS ou um arquivo de texto e, em seguida, escolher um tipo de gráfico para análise de citometria de fluxo. Ele fornece gráficos Histograma, Dotplot e Distribuição cumulativa para visualizar dados de citometria de fluxo. Você pode escolher um parâmetro para plotar o respectivo gráfico, como FSC-A, FSC-H, FSC-W, SSC-A, SSC-H, SSC-W, Tempo etc. Confira este link para conheça esses parâmetros.
Alguns recursos deste software de citometria de fluxo a serem observados:
- Permite extrair dados estatísticos inteiros ou dados parciais para um arquivo de texto.
- Você pode abrir diferentes tipos de gráficos em diferentes guias neste software.
- Em uma guia de plotagem, você obtém ferramentas como pan, zoom, subplots, line, paste gates etc.
- Fornece o recurso Clustering para criar clustersrs selecionando vários parâmetros. Aqui, você obtém os tipos de clusters Inicialização estática, Divisão binária e Inicialização aleatória.
- Fornece ferramentas de análise de dados, como Subtração de Histograma e Estatísticas (Estatística Total e Estatística de Gate).
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Cyflogic
Cyflogic é outro software de fluxo livre para analisar flois dados de citometria. Ele fornece ferramentas estatísticas Dot Plot, Histogram, Histogram Modeller, Overlay Histogram, 3D Plot e ClipBook para visualizar arquivos FCS. Existem muitos recursos fornecidos neste software para permitir que você execute a análise de citometria de fluxo. Isso inclui as seguintes opções:
- Você pode abrir e visualizar estatísticas, incluindo número, média X, média Y, % de visível, média geográfica X e média geográfica Y.
- Permite personalizar a plotagem usando opções como Mostrar/ocultar quadrante, mostrar/ocultar linhas de região, inverter cor de fundo, ativar/desativar multicoloração, alterar cor de plotagem, mostrar/ocultar linhas de marcação, definir suavização, etc.
- Você pode definir o limite de sorteio rápido e o número máximo de eventos.
- Você pode copiar ou até mesmo salvar dados de plotagem como arquivo TXT. Também permite exportar o diagrama de plotagem como imagem BMP. Além disso, você pode salvar a visualização de análise para uso posterior.
- Algumas ferramentas adicionais oferecidas neste software são Batch Print, Rotação de 360 graus, File Browser, Well Plate Browser, etc.
Observação: é gratuito apenas para uso não comercial e acadêmico.
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FCSalyzer
FCSalyzer é outro software fluido nesta lista. Também permite abrir e analisar documentos FCS. Vamos verificar as etapas para fazer isso.
Como analisar dados de citometria de fluxo usando este software gratuito
Primeiro, você precisa selecionar um tipo de gráficoe de sua interface. Ele permite que você analise dados de citometria de fluxo na forma de Dot Plot, Histogram, e Density Plot. Agora, selecione um arquivo FCS para plotar o respectivo diagrama. Tão simples como isso. Você pode usar suas ferramentas como Quadrant, Marker, Adjust Regions and Gates, Text Area, etc. para analisar o gráfico. Ele também lista dados brutos, estatísticas, etc. Você também pode exportar estatísticas para um arquivo de texto, salvar plotagem como imagem PNG, exportar eventos de plotagem para um arquivo CSV, etc. seu formato de arquivo nativo para que você possa abri-lo mais tarde.
No geral, é um software agradável e portátil. Assim, você pode carregá-lo em um dispositivo de armazenamento portátil e usá-lo em qualquer lugar.
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Sinfonia Celular
Cellular Symphony é um tipo diferente de software fluido nesta lista. É basicamente uma representação musical de dados de citometria de fluxo onde as células são denotadas por notas musicais. Simplesmente arraste os arquivos FCS para sua seção de arquivos, escolha um deles e selecione Parâmetros de afinação. Os parâmetros de pitch incluem FSC-A, FSC-W, FSC-H, SSC-A, SSC-H, SSC-W, Time, IL2 PE, Dump, etc. Você pode saber mais sobre esses parâmetros aqui. Agora, selecione os respectivos instrumentos para tocar cada um. Você também pode selecionar o volume da nota, a duração da nota de cada célula, e número total de células a serem tocadas. Depois disso, pressione o botão play e ele exibirá o gráfico de pontos, como você pode ver na captura de tela acima. Você pode ajustar o tamanho do ponto plotado e ativar ou desativar a grade também.
Também fornece uma opção Gravar para gravar um arquivo MIDI de som gerado. No entanto, esta função não funcionou bem para mim durante o teste.
Este também é um software de citometria de fluxo portátil que não precisa de instalação e pode ser usado em qualquer lugar.