Este artigo contém uma lista dos melhores conversores gratuitos de PDB para PDF software para Windows. Usando este software gratuito, você pode converter a estrutura molecular armazenada em um arquivo Protein Data Bank (PDB) para Portable Document Format ( PDF). Basicamente, você pode salvar a visualização de uma estrutura molecular em um formato imprimível como PDF. Para fazer isso, você pode até personalizar a visualização molecular configurando vários parâmetros de exibição, como estilo de visualização (Wireframe, Backbone, Sticks, Spacefill, Balls & Stick, Ribbons, etc.), esquema de cores, mostrar ou ocultar rótulos, visualização molecular (átomos, hidrogênio, etc.), etc. Você também pode girar ou ampliar a estrutura molecular e depois converter a visualização para o formato PDF.
Muitos desses softwares listados são softwares de modelagem molecular. Portanto, você pode modificar a estrutura usando as ferramentas de construção de moléculas disponíveis, como adicionar átomos, adicionar hidrogênio, adicionar estrutura químicaures, etc. Além disso, eles são muito bons na visualização de moléculas, pois fornecem um bom conjunto de ferramentas de visualização, como girar, ampliar, modo de exibição, mostrar rótulos, mover, girar, etc. Além disso, muitos deles também mostram estatísticas relacionadas ao modelo molecular e fornecem ferramentas de cálculo e análise.
Além do PDB, você também pode converter outros arquivos moleculares em PDF na maioria desses softwares. Os formatos de entrada mais comumente suportados incluem MOL, MOL2, ENT, XYZ e CML. Quanto à saída, você pode converter PDB em vários formatos de imagem como PNG, BMP, JPG, PS, EPS, etc. Leia o artigo para saber mais sobre esses softwares.
Meu software conversor gratuito de PDB para PDF favorito para Windows:
Avogadro é meu software conversor de PDB para PDF favorito nesta lista, pois é um software avançado que também é bom para visualização e modelagem de moléculas. Também é bem projetado com algumas ferramentas adicionais relacionadas à modelagem molecular.
Molekel ié outro bom que você pode tentar converter PDB para PDF.
Avogrado
Avogadro é um dos softwares de modelagem molecular de código aberto mais populares para Windows, Linux e Mac. Também pode ser usado para converter PDB em PDF, pois fornece um recurso dedicado para isso. Você também pode usá-lo para converter PDB para outros formatos, incluindo PNG, BMP, JPG, SVG, EPS, POV, VRML, etc.
Geralmente, este software é usado para visualização, construção e edição de moléculas. Para fazer isso, ele contém um conjunto rico em recursos de ferramentas que podem ser usadas. Algumas de suas ferramentas incluem projeção Perspectiva ou Ortogonal, Modo de Tela Cheia, Adicionar Hidrogênios, Inserir (Fragmento, DNA/RNA, SORRISOS, e Peptídeo), Super Cell Builder, Nanotube Builder, Alterar H para Metil, Editor Cartesiano, etc.
Como converter PDB para PDF no Avogadro:
- Usando seu recurso aberto, importe um arquivo PDB para este software.
- Edite o modelo molecular com as ferramentas disponíveis, se necessário.
- Agora, vá para o menu Arquivo e clique na opção Exportar > Gráficos vetoriais e selecione PDF como formato de saída para salvar a visualização molecular no formato PDF.
Antes da conversão de PDB para PDF, você pode personalizar as configurações de exibição para exportar uma visualização personalizada de moléculas para um PDF ou arquivo gráfico. Essas configurações de exibição incluem mostrar/ocultar eixos, força, dipolo, polígono, anel, bastão, superfícies, estrutura de arame, etc.
Recursos adicionais:
- Ele contém várias extensões que aprimoram ainda mais sua funcionalidade, como Otimizar geometria, Calcular energia, Pesquisa de conformidade, GLSL Shaders, etc.
- Além do PDB, ele suporta vários formatos de arquivo de entrada como CML, XYZ, MOL, MOL2, ENT, GAMOUT, etc.
Conclusão:
É um excelente software conversor gratuito de PDB para PDF de código aberto que oferece boa qualidade deutput. Você também pode modificar o arquivo PDB antes de iniciar a conversão para PDF ou qualquer formato gráfico.
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Molécula
Molekel é um software visualizador de arquivos moleculares gratuito que também pode ser usado para converter PDB em PDF. Ele fornece uma opção direta para converter arquivos PDB para o formato PDF. Assim, você pode facilmente importar um arquivo de estrutura PDB e salvá-lo em um arquivo PDF. Além disso, você pode converter outros arquivos moleculares em PDF, pois suporta um wi-fi.o número de formatos de entrada, incluindo XYZ, YOB, ALC, SDF, SMI, RXN, PCM, PQS, MOL, MOL2, TMOL, etc.
Como converter PDB para PDF em Molekel:
- Basta abrir um arquivo PDB nele que você pode visualizar e analisar corretamente usando suas ferramentas de visualização avançadas.
- Agora, no menu Arquivo, clique na opção Salvar em PDF para converter PDB em PDF.
Recursos adicionais:
- Você pode personalizar várias configurações de exibição antes de converter a estrutura do PDB em PDF, como plano de fundo, visualização de moléculas (bola e bastão, bastão, estrutura de arame, etc.), átomo, ligação, propriedades de visualização 3D, etc.
- Permite gravar animação molecular e exportá-la.
- Ele fornece alguns recursos de análise, incluindo sonda plana, distância, ângulo, ângulo diedro e espectro de radiação.
- Você pode converter PDB e outros arquivos de estrutura molecular em imagens PS, EPS, PNG e TIFF.
- Você também pode visualizar as propriedades e estatísticas básicas do modelo molecular relacionadas a átomos, ligações, energia, resíduos, confórmeros, massa molar, massa exata, multiplicidade de spin, frequências de vibração, etc.
Conclusão:
É um bom conversor de PDB para PDF que também fornece algumas ferramentas avançadas de visualização molecular.
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RasMol
RasMol é outro software gratuito conversor de PDB para PDF para Windows. É uma toupeira legalvisualizador de arquivos cular que você também pode usar para converter PDB ou outro arquivo de entrada suportado para vários outros formatos. Esses formatos incluem BMP, GIF, IRIS RGB, PPM, Sun Raster, PostScript, POVRay, VRML, Raster3D, etc. No entanto, para converter PDB em PDF, você terá que usar o recurso Imprimir. Vamos verificar as etapas classificadas que você precisa executar para converter uma estrutura molecular salva no arquivo PDB para PDF.
Como converter PDB para PDF no RasMol:
- Importe um arquivo PDB usando a opção Abrir.
- Depois disso, você pode configurar a exibição da estrutura molecular usando as opções disponíveis, como modo de exibição (wireframe, backbone, bastões, bola e bastões, fitas, fios, etc.), cores (monocromático, cadeia, temperatura, habilitar ou desative opções como modos slab, hidrogênios, heteroátomos, rótulos, estéreo etc. e muito mais.
- Agora você pode usar o recurso imprimir para converter a visualização personalizada da estrutura molecular PDB para o formato PDF.
Coinclusão:
É outro bom software conversor de PDB para PDF, pois você também pode converter PDB para vários outros formatos gráficos, conforme mencionado acima. Além disso, ele suporta muitos outros formatos de arquivo como entrada além do PDB, como Alchemy File Format, Sybyl MOL2 Format, MDL Mol File Format, CIF File Format, MOPAC File Format, etc.
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ArgusLab
ArgusLab é um software gratuito de construção molecular que você podese para converter PDB para PDF. Usando-o, você pode facilmente importar e visualizar arquivos de dados moleculares, como PDB, XYZ, MOL, MOL2, etc., bem como converter esses arquivos em outros formatos, incluindo PDF, TIFF, BMP, JPG e POV. Como permite construir modelos moleculares, você também pode editar um arquivo PDB antes da conversão.
Como converter PDB para PDF usando o ArgusLab:
- Primeiramente, abra um arquivo PDB nele que você poderá visualizar em sua interface.
- Agora, se necessário, você pode modificar o modelo molecular usando ferramentas como modo de tradução, adicionar átomos, adicionar hidrogênios, excluir hidrogênio, criar e editar superfícies, etc.
- A seguir, para salvar a visualização do modelo PDB em formato PDF, clique no menu Arquivo > opção Imprimir e selecione “Microsoft Print to PDF” como impressora. Dessa forma, você poderá converter PDF para PDF.
Recursos adicionais:
- Permite explorar diferentes elementos de um PDB ou qualquer outro arquivo molecular, como Átomos, Resíduos, Grupos, etc.
- Épermite realizar vários cálculos relacionados ao modelo molecular, como energia, otimização de geometria, gaussiano, etc.
Conclusão:
É um software de construção de moléculas em destaque que também atua como um conversor de PDB para PDF.
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Jmol
Jmol é outro software conversor gratuito de PDB para PDF de código aberto para Windows. É um bom software modelador de moléculas usando o qual você pode visualizar, editar e construir moléculasar arquivos. Além do PDB, ele funciona com alguns outros formatos como MOL, MOL2, XYZ, CML, ENT e muitos outros formatos de arquivos de moléculas incomuns.
Como converter PDB para PDF usando este modelador molecular gratuito de código aberto:
- Primeiramente, vá ao menu Arquivo e use a opção Abrir para importar um arquivo PDB nele.
- Agora você pode editar a estrutura molecular usando as ferramentas de modelagem disponíveis.
- Depois disso, use o recurso Imprimir para converter o formato PDB para PDF. Ao fazer isso, certifique-se de definir a impressora como Microsoft Print para PDF.
Recursos adicionais:
- Ele contém algumas ferramentas adicionais que você pode usar de acordo com seus requisitos, como Animar, Medições, Vibrar, Ferramenta de Superfície, Criar Arquivo de Entrada Gaussiano, etc.
Conclusão:
É um bom conversor portátil de PDB para PDF que não requer instalação. Você pode usá-lo diretamente em qualquer lugar a partir de qualquer dispositivo de armazenamento portátil.
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BALLView
BALLView é mais um software conversor gratuito de PDB para PDF de código aberto nesta lista. Como outros softwares listados, ele também permite importar um arquivo PDB e imprimir a visualização da estrutura molecular em formato PDF. Além do PDF, você também pode usá-lo para converter PDB para outros formatos, incluindo PNG, POV, XHTML, VRML e STL.
Além do PDB, ele suporta alguns outros formatos de arquivos químicos que você pode visualizar, editar ou converter. Esses formatos de entrada incluem MOL, MOL2, XYZ, ENT, AC, SD, etc.
Como converter PDB para PDF usando BALLView:
- O primeiro passo é importar umPDB usando a opção Arquivo > Abrir > Estrutura.
- Em seguida, use a opção Imprimir e selecione Microsoft Print to PDF como impressora para converter PDB em PDF.
Conclusão:
É outra alternativa decente para converter um arquivo de banco de dados de proteínas para o formato PDF.