Aqui está uma lista dos melhores sites gratuitos de visualização de moléculas online. Uma molécula ou arquivo molecular contém dados sobre átomos, resíduos, nomes de segmentos, ocupação, fator beta, conjuntos de coordenadas, etc., de uma estrutura molecular. Existem muitos tipos de arquivos de moléculas, como PDB, SDF, CDX, CDXML, e mais. Se você deseja visualizar e analisar a estrutura molecular presente em um arquivo de molécula, verifique esses sites de visualização de moléculas on-line. Todos esses sites são totalmente gratuitos. Além disso, os usuários podem acessá-los de qualquer lugar sem muito trabalho.
Nesses sites, os usuários podem carregar um arquivo de molécula para visualizar a estrutura molecular. Para mostrar a estrutura molecular, a maioria dos sites emprega abordagem 3D ou tridimensional. Embora alguns sites ainda usem a abordagem 2D para mostrar a estrutura molecular. Todas as ferramentas básicas de interação estão presentes em todos esses sites através dos quais os usuários podem rodar, mover, e ampliar a estrutura de uma molécula. Além disso, os usuários também podem encontrar ferramentas avançadas como Anaglyph Stereo, Data Viewer, Show Symmetry, etc., ferramentas para visualizar uma estrutura molecular. Por meio de alguns sites, os usuários também podem alterar o tipo de estrutura molecular, a cor de fundo, destacar tipos específicos de átomos e muito mais. Depois de visualizar a estrutura de uma molécula, os usuários podem exportá-la nos formatos PDB, FBX, MDL, SMD, etc.
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Esses sites também vêm com ferramentas adicionais que podem ser úteis. Usando ferramentas adicionais, os usuários podem medir a estrutura molecular, fazer capturas de tela, renderizar restrições e muito mais. Percorra a lista para saber mais sobre esses sites.
Meu site de visualização de moléculas on-line favorito:
webmo.net é meu site favorito, pois oferece suporte a arquivos de moléculas de vários formatos. Além disso, também oferece todas as ferramentas essenciais para visualizar e analisar a estrutura de uma molécula.
webmo.net
webmo.net é um site de visualização molecular online gratuito. Usando este site, os usuários podem visualizar facilmente os designs moleculares presentes nos formatos de arquivo PDB e SDF. Ele também oferece vários mecanismos para calcular e mostrar o design molecular, como Gaussian, Molpro, Molpac, Tinker, QChem, etc. Além disso, uma seção dedicada ao Molecule Viewer também está presente nele. Agora, confira os principais recursos deste site.
Principais características:
- Molecule Viewer: É o principal visualizador deste site no qual os usuários podem visualizar a estrutura da molécula presente no arquivo da molécula. Ele também oferece ferramentas para mover a estrutura e aumentar o zoom na molécula.
- Mostrar elementos de simetria: Use-o para visualizar os elementos de simetria da estrutura de uma molécula.
- Calcular: usando esta ferramenta, os usuários podem calcular orbitais moleculares, densidade de elétrons, potencial eletrostático e muito mais.
- Visualizador de dados: é outra ferramenta útil que permite aos usuários visualizar todos os dados associados a um arquivo de molécula.
Recurso adicional:
- Preferências: contém várias opções por meio das quais os usuários podem cores orbitais, cores de moléculas, valor de isosuperfície e muito mais.
- Limpeza: Oferece ferramentas avançadas através das quais os usuários podem gerar ligações, otimizar a mecânica da estrutura, adicionar hidrogênios, etc.
Considerações finais:
É um dos melhores sites de moléculas on-line gratuitos nos quais os usuários podem facilmente visualizar e analisar estruturas moleculares.
Visualizador Jena3D
Jena3D Viewer é outro visualizador de moléculas on-line gratuito. Como o nome deste site sugere, ele mostra a estrutura da molécula em formato 3D. Também gosto de sua capacidade de suportar arquivos de moléculas de vários formatos, como PDB, mmCif, CIF, CML, MOL, XYZ, e muito mais. Agora, confira as principais características deste site.
Principais características:
- Visualizador 3D: Depois de carregar um arquivo de molécula, um visualizador 3D será aberto mostrando a estrutura molecular em várias cores. os usuários podem interagir facilmente com o visualizador em 3D para girar a estrutura e ampliar a estrutura.
- Rendering: use-o para alterar a renderizaçãotipo de estrutura de vários disponíveis, como Cartoon, Ribbon, Strands, backbone, Trace, etc.
- Seleção de Átomos: É uma ferramenta útil através da qual os usuários podem destacar átomos específicos de uma estrutura molecular, como Proteína, Nucléico, Backbone, Sidechain, Solvente, etc.
- Janela gráfica: use-a para alterar manualmente o tamanho da janela do visualizador em 3D.
Recursos adicionais:
- Este site oferece vários recursos adicionais, como suporte a script, coloração de plano de fundo, coloração de moléculas e muito mais.
Considerações finais:
É outro site visualizador de moléculas on-line através do qual os usuários podem facilmente destacar átomos de diferentes tipos.
molsoft.com
molsoft.com é um site de visualização de moléculas on-line gratuito. Usando este site, os usuários podem carregar qualquer arquivo de molécula na forma de um formato de arquivo PDB. Depois de carregar um arquivo PDB, os usuários podem analisar de perto a estrutura molecular. Agora, confira as principais características deste site.
Principais características:
- Estrutura molecular 3D: neste site, os usuários podem visualizar a estrutura molecular tridimensional de um arquivo de molécula. Além disso, também mostra diferentes elementos de uma molécula em cores distintas.
- Interação e zoom: este site também permite que os usuários interajam com a estrutura molecular por meio do mouse. Além disso, também permite aos usuários aumentar o zoom na moléculas para uma inspeção mais detalhada.
- Anaglyph Stereo: este recurso cria uma cópia da estrutura molecular existente.
- Rocking: uma vez ativado, esse recurso balança ou move automaticamente a direção da estrutura molecular.
- Exibição: use-o para visualizar a estrutura molecular de várias maneiras, como Modo de fio, Modo CPK, Modo de bola e bastão, etc.
- Rótulos: Adiciona rótulos atômicos sobre a estrutura molecular.
Recursos adicionais:
- Este site oferece vários recursos adicionais por meio dos quais os usuários podem alterar a cor do plano de fundo, medir a estrutura molecular, capturar moléculas na forma de uma imagem e muito mais.
Considerações finais:
É um site visualizador de moléculas on-line rico em recursos, através do qual os usuários podem facilmente visualizar e analisar estruturas moleculares.
Olhar
Miew é um visualizador molecular on-line gratuito e de código aberto. Este site mostra dados moleculares em belo formato 3D. No entanto, ele suporta apenas arquivos de moléculas no formato PDB. Ele vem com vários modos de exibição e exibe modos de cores que os usuários podem alternar facilmente. Além disso, recursos essenciais de rotação e zoom também estão presentes nele. Agora, confira os principais recursos.
Principais características:
- Visualização molecular 3D: este site mostra a estrutura da molécula em forma tridimensional.
- Modelo de interação: este site também permite que os usuários iinteragem com estruturas moleculares. Além disso, também permite que os usuários selecionem uma parte da estrutura da molécula para visualizar o número de átomos presentes na parte selecionada e o tipo de parte selecionada.
- Modos de exibição: este site oferece vários modos de exibição para visualizar uma estrutura molecular, como Linhas, Bolas, Traço, Tubo, Texto e muito mais.
- Predefinições de cores de exibição: ele vem com muitas predefinições de cores de exibição para visualizar uma estrutura como Sequência, Cadeia, Uniforme, Temperatura, Ocupação e muito mais.
- Exportar: Use-o para exportar o arquivo da molécula no formato de arquivo FBX.
Recurso adicional:
- Este site oferece muitos recursos adicionais, como captura de tela, obter URL, salvar configurações, renderizar configurações e muito mais.
Considerações finais:
É outro bom site de visualização molecular on-line, através do qual os usuários podem facilmente visualizar e analisar moléculas e moleculasr estruturas.
rcsb.org
rcsb.org é outro visualizador molecular online gratuito. Através deste site, os usuários podem visualizar estruturas moleculares presentes em arquivos moleculares de vários formatos, como SDF, PDB, MRC, MAP, e muito mais. Agora, confira as principais características deste site.
Principais características:
- Visualização em 3D: este site mostra uma visualização em 3D da estrutura molecular.
- Interação e análise: este site permite que os usuários interajam com a estrutura molecular e analisem de pertousando o recurso de zoom.
- Componentes: usando-o, os usuários podem selecionar uma parte da estrutura e visualizar todos os seus componentes.
- Exportar: Use-o para exportar a estrutura da molécula no formato zip compactado.
Recursos adicionais:
- Medição: esta seção traz ferramentas para medir e distância entre estruturas moleculares.
- Exportar animação: esse recurso cria uma animação de movimento básica e permite que os usuários a exportem no formato de vídeo MP4.
Considerações finais:
É outro bom site molecular on-line no qual os usuários podem facilmente visualizar e analisar arquivos de moléculas.
BarChem Sketcher
PubChem Sketcher é mais um site de visualização de moléculas on-line gratuito. Este site mostra a estrutura molecular no formato 2D. Ele também mostra nomes de moléculas e átomos com a estrutura da molécula. Além disso, também pode ser usado para editar os modelos moleculares existentes. Agora, dê uma olhada nos principais recursos deste site.
Principais características:
- Suporte a vários arquivos de moléculas: este site oferece suporte a arquivos de moléculas de vários formatos, como PDB, SDF, MDL, CDX, e mais.
- Molecule Viewer: é o principal visualizador no qual os usuários podem visualizar a estrutura molecular contida em um arquivo de molécula em formato de arquivo 2D junto com as informações adicionais da molécula.
- Edição: Para editar a estrutura da molécula existente, oferece várias ligações de moléculas, formas de moléculas, elementos, etc., ferramentas.
- Exportar: depois de vExibindo e editando a estrutura de uma molécula, os usuários podem exportá-la em vários formatos como MDL, INCHL, SMD, JME, PNG, etc., formatos de arquivo.
Considerações finais:
É outro bom site visualizador de moléculas on-line que não apenas permite que os usuários visualizem, mas também modificam a estrutura da molécula.
EzMol
EzMol é o último site de visualização de moléculas on-line gratuito. Neste site, os usuários podem visualizar facilmente os arquivos de moléculas nos formatos PDB e EZM. Depois de carregar um arquivo de molécula, basta pressionar o botão Enviar para visualizar a estrutura molecular. Agora, confira os principais recursos deste site.
Main Fcaracterísticas:
- Ferramentas de interação do modelo na tela: este site oferece várias ferramentas na tela para girar, mover, ampliar, rolar e balançar o modelo da molécula.
- Cadeias laterais: Use-o para destacar as cadeias laterais de uma estrutura molecular em várias cores.
- Estilo: Através desta ferramenta, os usuários podem alterar o tipo de backbone da estrutura de vários disponíveis como Cartoon, Stick, Hide, etc.
- Superfícies: use-o para ajustar manualmente o tipo de superfície, cor e transparência da estrutura molecular.
Recursos adicionais:
- Por meio das ferramentas adicionais deste site, os usuários podem renderizar a estrutura, alterar a cor de resíduos individuais, alterar a cor de fundo da estrutura e muito mais.
Considerações finais:
É outro bom site visualizador de moléculas que qualquer pessoa pode usar sem muita dificuldade.